Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms