Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms