Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RELBQ01201 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RELBQ01201 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RELBQ01201 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RELBQ01201 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RELBQ01201 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RELBQ01201 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RELBQ01201 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RELBQ01201 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RELBQ01201 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RELBQ01201 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RELBQ01201 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RELBQ01201 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RELBQ01201 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RELBQ01201 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RELBQ01201 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RELBQ01201 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RELBQ01201 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RELBQ01201 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RELBQ01201 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RELBQ01201 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RELBQ01201 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RELBQ01201 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RELBQ01201 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RELBQ01201 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RELBQ01201 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RELBQ01201 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms