Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms