Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms