Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-21P61565 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms