Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms