Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCE1P61221 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms