Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1P60507 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms