Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA3P59666 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA3P59666 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA3P59666 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA3P59666 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA3P59666 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA3P59666 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA3P59666 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA3P59666 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA3P59666 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA3P59666 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA3P59666 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA3P59666 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA3P59666 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA3P59666 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms