Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D1P54289 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms