Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB5CP51148 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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RAB5CP51148 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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RAB5CP51148 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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RAB5CP51148 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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RAB5CP51148 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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RAB5CP51148 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB5CP51148 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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