Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERFP50548 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERFP50548 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERFP50548 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms