Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX2P50458 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX2P50458 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
LHX2P50458 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LHX2P50458 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LHX2P50458 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LHX2P50458 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LHX2P50458 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX2P50458 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX2P50458 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX2P50458 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX2P50458 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX2P50458 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX2P50458 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX2P50458 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX2P50458 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX2P50458 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX2P50458 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX2P50458 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms