Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLK1P49759 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLK1P49759 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLK1P49759 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLK1P49759 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLK1P49759 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLK1P49759 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLK1P49759 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLK1P49759 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLK1P49759 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLK1P49759 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLK1P49759 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLK1P49759 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms