Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A3P48764 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms