Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NESP48681 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NESP48681 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NESP48681 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NESP48681 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NESP48681 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NESP48681 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NESP48681 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NESP48681 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NESP48681 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NESP48681 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NESP48681 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NESP48681 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NESP48681 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NESP48681 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NESP48681 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NESP48681 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NESP48681 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NESP48681 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NESP48681 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NESP48681 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NESP48681 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NESP48681 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NESP48681 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NESP48681 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NESP48681 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NESP48681 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NESP48681 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NESP48681 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NESP48681 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NESP48681 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NESP48681 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NESP48681 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NESP48681 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
NESP48681 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NESP48681 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NESP48681 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NESP48681 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NESP48681 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
NESP48681 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NESP48681 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
NESP48681 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NESP48681 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NESP48681 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NESP48681 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NESP48681 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NESP48681 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NESP48681 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NESP48681 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NESP48681 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NESP48681 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NESP48681 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NESP48681 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NESP48681 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NESP48681 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NESP48681 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NESP48681 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NESP48681 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NESP48681 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NESP48681 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NESP48681 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NESP48681 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NESP48681 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NESP48681 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NESP48681 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NESP48681 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NESP48681 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NESP48681 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NESP48681 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NESP48681 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NESP48681 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NESP48681 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NESP48681 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NESP48681 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NESP48681 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NESP48681 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NESP48681 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NESP48681 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NESP48681 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NESP48681 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NESP48681 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NESP48681 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NESP48681 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NESP48681 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NESP48681 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NESP48681 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NESP48681 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NESP48681 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NESP48681 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NESP48681 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NESP48681 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NESP48681 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NESP48681 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NESP48681 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NESP48681 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NESP48681 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NESP48681 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NESP48681 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NESP48681 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NESP48681 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms