Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA4P43681 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA4P43681 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA4P43681 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA4P43681 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA4P43681 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA4P43681 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA4P43681 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA4P43681 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA4P43681 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA4P43681 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA4P43681 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA4P43681 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHRNA4P43681 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHRNA4P43681 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHRNA4P43681 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHRNA4P43681 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHRNA4P43681 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA4P43681 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms