Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRPPRCP42704 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms