Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms