Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA4P35212 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA4P35212 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA4P35212 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA4P35212 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA4P35212 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA4P35212 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA4P35212 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA4P35212 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA4P35212 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA4P35212 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA4P35212 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA4P35212 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA4P35212 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA4P35212 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA4P35212 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA4P35212 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA4P35212 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA4P35212 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA4P35212 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA4P35212 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA4P35212 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA4P35212 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA4P35212 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA4P35212 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA4P35212 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA4P35212 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA4P35212 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA4P35212 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA4P35212 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA4P35212 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA4P35212 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA4P35212 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA4P35212 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA4P35212 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA4P35212 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA4P35212 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA4P35212 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA4P35212 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms