Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKBRP32239 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms