Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5DP30049 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms