Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms