Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms