Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LMO1P25800 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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LMO1P25800 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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