Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA1P25391 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms