Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PRPH2P23942 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms