Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRZ1P23471 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRZ1P23471 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms