Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR4A1P22736 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NR4A1P22736 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms