Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMC1P11047 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms