Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUP10909 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUP10909 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLUP10909 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLUP10909 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLUP10909 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLUP10909 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLUP10909 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLUP10909 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLUP10909 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLUP10909 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CLUP10909 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLUP10909 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLUP10909 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLUP10909 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLUP10909 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms