Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI4P10075 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI4P10075 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI4P10075 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI4P10075 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI4P10075 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI4P10075 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI4P10075 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI4P10075 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI4P10075 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI4P10075 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI4P10075 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI4P10075 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLI4P10075 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLI4P10075 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLI4P10075 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLI4P10075 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLI4P10075 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLI4P10075 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLI4P10075 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLI4P10075 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLI4P10075 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLI4P10075 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLI4P10075 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLI4P10075 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLI4P10075 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLI4P10075 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GLI4P10075 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms