Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TMEM225BP0DP42 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TMEM225BP0DP42 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TMEM225BP0DP42 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM225BP0DP42 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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