Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGA3P0DJD8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms