Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD2P0DJD1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms