Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NGFRP08138 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms