Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms