Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PF4P02776 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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PF4P02776 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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PF4P02776 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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PF4P02776 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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PF4P02776 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PF4P02776 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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