Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms