Protein–RNA interactions for Protein: O75581

LRP6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP6O75581 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP6O75581 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP6O75581 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP6O75581 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP6O75581 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP6O75581 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP6O75581 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP6O75581 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP6O75581 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP6O75581 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP6O75581 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP6O75581 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP6O75581 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP6O75581 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP6O75581 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP6O75581 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP6O75581 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP6O75581 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP6O75581 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP6O75581 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP6O75581 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP6O75581 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP6O75581 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP6O75581 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP6O75581 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP6O75581 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP6O75581 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP6O75581 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP6O75581 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP6O75581 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP6O75581 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP6O75581 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP6O75581 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP6O75581 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP6O75581 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP6O75581 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP6O75581 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP6O75581 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP6O75581 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP6O75581 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP6O75581 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP6O75581 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP6O75581 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP6O75581 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP6O75581 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP6O75581 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP6O75581 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP6O75581 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP6O75581 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP6O75581 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP6O75581 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP6O75581 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP6O75581 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP6O75581 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP6O75581 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP6O75581 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP6O75581 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP6O75581 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP6O75581 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP6O75581 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP6O75581 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP6O75581 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP6O75581 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP6O75581 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP6O75581 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP6O75581 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP6O75581 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP6O75581 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP6O75581 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP6O75581 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP6O75581 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP6O75581 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP6O75581 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP6O75581 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP6O75581 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP6O75581 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP6O75581 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP6O75581 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP6O75581 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP6O75581 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP6O75581 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP6O75581 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP6O75581 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP6O75581 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP6O75581 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP6O75581 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP6O75581 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP6O75581 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP6O75581 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP6O75581 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP6O75581 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP6O75581 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP6O75581 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP6O75581 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP6O75581 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP6O75581 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP6O75581 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP6O75581 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP6O75581 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP6O75581 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms