Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms