Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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PRAMEF10O60809 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PRAMEF10O60809 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PRAMEF10O60809 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PRAMEF10O60809 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRAMEF10O60809 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRAMEF10O60809 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRAMEF10O60809 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRAMEF10O60809 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRAMEF10O60809 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRAMEF10O60809 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRAMEF10O60809 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRAMEF10O60809 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRAMEF10O60809 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRAMEF10O60809 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms