Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms