Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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HOXA3O43365 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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HOXA3O43365 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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HOXA3O43365 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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HOXA3O43365 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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HOXA3O43365 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXA3O43365 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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