Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FANCAO15360 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FANCAO15360 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FANCAO15360 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FANCAO15360 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FANCAO15360 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FANCAO15360 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FANCAO15360 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FANCAO15360 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FANCAO15360 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FANCAO15360 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
FANCAO15360 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FANCAO15360 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCAO15360 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCAO15360 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCAO15360 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCAO15360 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCAO15360 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCAO15360 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCAO15360 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCAO15360 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCAO15360 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCAO15360 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCAO15360 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCAO15360 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCAO15360 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCAO15360 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCAO15360 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCAO15360 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCAO15360 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCAO15360 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCAO15360 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FANCAO15360 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCAO15360 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCAO15360 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCAO15360 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCAO15360 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCAO15360 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCAO15360 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCAO15360 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCAO15360 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCAO15360 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCAO15360 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCAO15360 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCAO15360 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCAO15360 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCAO15360 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCAO15360 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCAO15360 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCAO15360 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FANCAO15360 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCAO15360 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCAO15360 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCAO15360 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCAO15360 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCAO15360 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCAO15360 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCAO15360 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCAO15360 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCAO15360 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCAO15360 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCAO15360 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCAO15360 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCAO15360 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCAO15360 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCAO15360 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCAO15360 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCAO15360 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCAO15360 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCAO15360 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCAO15360 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCAO15360 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCAO15360 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCAO15360 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCAO15360 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCAO15360 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCAO15360 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FANCAO15360 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms