Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms