Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms