Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVV-2B6SEH9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVV-2B6SEH9 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms