Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRR3A8MPY1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms